MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 plasmid pPSEST02

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019938	GC	3	6	45	50	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019938	TTGG	2	8	57	64	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019938	GGCA	2	8	70	77	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019938	GA	3	6	93	98	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019938	GAA	2	6	174	179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019938	GCC	2	6	271	276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_019938	CAG	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019938	GTG	2	6	567	572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019938	GC	3	6	1430	1435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019938	CGG	2	6	1920	1925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019938	C	6	6	1969	1974	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_019938	AGG	2	6	1991	1996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019938	TTTGCG	2	12	2059	2070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019938	GC	3	6	2148	2153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019938	CCG	2	6	2160	2165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019938	T	7	7	4114	4120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019938	GTG	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019938	TGG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019938	GTG	2	6	4160	4165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019938	CTT	2	6	4167	4172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019938	CCA	2	6	4182	4187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_019938	TGG	2	6	4226	4231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019938	TGG	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019938	GCC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019938	AC	3	6	4302	4307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019938	ACC	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_019938	CAC	2	6	4342	4347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_019938	GTG	2	6	4385	4390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019938	GTG	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019938	CCA	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019938	CAC	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_019938	CCA	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019938	GC	3	6	4478	4483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019938	C	6	6	4533	4538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_019938	TG	3	6	4600	4605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019938	AC	3	6	4626	4631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019938	AC	3	6	5046	5051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019938	CCGCAG	2	12	5301	5312	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019938	CCA	2	6	5663	5668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019938	T	6	6	5689	5694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019938	GC	3	6	5796	5801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019938	GCC	2	6	5865	5870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019938	GA	3	6	5992	5997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019938	GGC	2	6	6017	6022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019938	CAG	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019938	C	6	6	6170	6175	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_019938	AC	3	6	6181	6186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019938	GACA	2	8	6189	6196	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019938	CGC	2	6	6280	6285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_019938	ACT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019938	AC	3	6	6350	6355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019938	TCT	2	6	6366	6371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019938	GAC	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019938	T	6	6	6412	6417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019938	CAG	2	6	6457	6462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019938	GCC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_019938	TGC	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019938	GCC	2	6	6568	6573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019938	CCA	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019938	CGC	3	9	6612	6620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019938	GC	3	6	7279	7284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019938	CCT	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_019938	GCCCC	2	10	7378	7387	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_019938	TGA	2	6	7390	7395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019938	GGC	2	6	7427	7432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019938	CTT	2	6	7453	7458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019938	TGG	3	9	7480	7488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019938	GCC	2	6	7583	7588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019938	CTG	2	6	7745	7750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019938	AC	3	6	7763	7768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019938	CCAT	2	8	7839	7846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019938	CTCGAC	2	12	7862	7873	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019938	CCCT	2	8	7901	7908	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_019938	CGC	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_019938	CGG	2	6	8011	8016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019938	GCC	3	9	8043	8051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_019938	GCC	2	6	8054	8059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019938	GCT	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019938	GCA	2	6	8073	8078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019938	AGC	3	9	8087	8095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019938	CTG	2	6	8126	8131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.